Q自分の場に『静かなる炎将・マーズ』がいる状況で、『マスターサムライ』が場に出た場合、《ファンファーレ》能力で相手の場のフォロワーに3ダメージ与えることができますか？

Aはい。3ダメージ与えることができます。
『マスターサムライ』が場に出たとき、『静かなる炎将・マーズ』の能力と『マスターサムライ』の《ファンファーレ》能力がそれぞれ誘発し、待機状態になります。待機状態になっている自動能力は任意の順番で解決で解決できるため、『静かなる炎将・マーズ』の能力を先に解決することで、『マスターサムライ』の攻撃力が+1され、その後『マスターサムライ』の《ファンファーレ》能力を解決することで3ダメージ与えることができます。